MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 93958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015564	CGA	2	6	220404	220409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917884
4502	NC_015564	CG	4	8	220442	220449	0 %	0 %	50 %	50 %	333917884
4503	NC_015564	CAT	2	6	220456	220461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917884
4504	NC_015564	CCA	2	6	220499	220504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917884
4505	NC_015564	AACG	2	8	220510	220517	50 %	0 %	25 %	25 %	333917884
4506	NC_015564	TCG	2	6	220532	220537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917884
4507	NC_015564	CGG	2	6	220560	220565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917884
4508	NC_015564	TAC	2	6	220603	220608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917884
4509	NC_015564	GC	3	6	220742	220747	0 %	0 %	50 %	50 %	333917885
4510	NC_015564	TCGTTG	2	12	220797	220808	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333917885
4511	NC_015564	TGG	2	6	220818	220823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917885
4512	NC_015564	GCG	2	6	220855	220860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917885
4513	NC_015564	TCG	2	6	220884	220889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917885
4514	NC_015564	ATCA	2	8	220922	220929	50 %	25 %	0 %	25 %	333917885
4515	NC_015564	CG	4	8	220972	220979	0 %	0 %	50 %	50 %	333917885
4516	NC_015564	GAG	2	6	221075	221080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917885
4517	NC_015564	ACG	2	6	221168	221173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917886
4518	NC_015564	CTG	2	6	221176	221181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917886
4519	NC_015564	GCGT	2	8	221238	221245	0 %	25 %	50 %	25 %	333917886
4520	NC_015564	CTC	2	6	221251	221256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917886
4521	NC_015564	CCCGGT	2	12	221308	221319	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333917886
4522	NC_015564	GAG	2	6	221402	221407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917886
4523	NC_015564	CTG	2	6	221410	221415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917886
4524	NC_015564	CGG	2	6	221528	221533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917886
4525	NC_015564	ACG	2	6	221606	221611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917886
4526	NC_015564	TGA	2	6	221654	221659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917887
4527	NC_015564	ACC	2	6	221665	221670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917887
4528	NC_015564	GCA	3	9	221684	221692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917887
4529	NC_015564	GAA	2	6	221724	221729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917887
4530	NC_015564	TCGCGG	2	12	221768	221779	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333917887
4531	NC_015564	AGA	2	6	221789	221794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917887
4532	NC_015564	CGA	2	6	221804	221809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917887
4533	NC_015564	CGA	2	6	221816	221821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917887
4534	NC_015564	GAC	2	6	221958	221963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917887
4535	NC_015564	GGC	2	6	222030	222035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917887
4536	NC_015564	CG	3	6	222069	222074	0 %	0 %	50 %	50 %	333917887
4537	NC_015564	C	6	6	222111	222116	0 %	0 %	0 %	100 %	333917887
4538	NC_015564	GAA	2	6	222141	222146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917887
4539	NC_015564	TGA	2	6	222158	222163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917887
4540	NC_015564	CCG	2	6	222172	222177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917887
4541	NC_015564	ACTCC	2	10	222191	222200	20 %	20 %	0 %	60 %	333917887
4542	NC_015564	TGG	2	6	222203	222208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917887
4543	NC_015564	GAC	2	6	222429	222434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917888
4544	NC_015564	AAC	2	6	222459	222464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917888
4545	NC_015564	GCA	2	6	222494	222499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917888
4546	NC_015564	ACT	2	6	222502	222507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917888
4547	NC_015564	TGG	2	6	222551	222556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917888
4548	NC_015564	CCG	2	6	222562	222567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917888
4549	NC_015564	GCC	3	9	222615	222623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917888
4550	NC_015564	TGG	2	6	222635	222640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917888
4551	NC_015564	CGA	2	6	222647	222652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917888
4552	NC_015564	CCG	2	6	222694	222699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917888
4553	NC_015564	CGA	2	6	222707	222712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917888
4554	NC_015564	GCG	2	6	222769	222774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917888
4555	NC_015564	CGG	2	6	222791	222796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917888
4556	NC_015564	GT	3	6	222797	222802	0 %	50 %	50 %	0 %	333917888
4557	NC_015564	TTC	2	6	222901	222906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917888
4558	NC_015564	CCGT	2	8	222915	222922	0 %	25 %	25 %	50 %	333917888
4559	NC_015564	CTTCTC	2	12	222939	222950	0 %	50 %	0 %	50 %	333917888
4560	NC_015564	GCTG	2	8	223040	223047	0 %	25 %	50 %	25 %	333917889
4561	NC_015564	GGC	2	6	223105	223110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917889
4562	NC_015564	CAG	2	6	223114	223119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917889
4563	NC_015564	CTA	2	6	223149	223154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917889
4564	NC_015564	CGA	2	6	223164	223169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917889
4565	NC_015564	TTC	2	6	223204	223209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917889
4566	NC_015564	TGC	2	6	223240	223245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917889
4567	NC_015564	GAA	2	6	223270	223275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917889
4568	NC_015564	AGC	3	9	223310	223318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917889
4569	NC_015564	CCAC	2	8	223395	223402	25 %	0 %	0 %	75 %	333917889
4570	NC_015564	GCG	2	6	223415	223420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917889
4571	NC_015564	CCA	2	6	223450	223455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917889
4572	NC_015564	GTGC	2	8	223646	223653	0 %	25 %	50 %	25 %	333917889
4573	NC_015564	GAG	2	6	223660	223665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917889
4574	NC_015564	GGA	2	6	223671	223676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917889
4575	NC_015564	ACGATC	2	12	223700	223711	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333917889
4576	NC_015564	GAT	2	6	223735	223740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917889
4577	NC_015564	ATC	2	6	223751	223756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917889
4578	NC_015564	TGC	2	6	223805	223810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917889
4579	NC_015564	TCG	2	6	223827	223832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917889
4580	NC_015564	GAAC	2	8	223842	223849	50 %	0 %	25 %	25 %	333917889
4581	NC_015564	ATG	2	6	223865	223870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917889
4582	NC_015564	GTC	2	6	223892	223897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917889
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4584	NC_015564	CGA	2	6	224119	224124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917890
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4586	NC_015564	GAG	2	6	224243	224248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917890
4587	NC_015564	CGC	2	6	224293	224298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917890
4588	NC_015564	TCG	2	6	224328	224333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917890
4589	NC_015564	ACA	2	6	224337	224342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917890
4590	NC_015564	ACG	2	6	224394	224399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917890
4591	NC_015564	TCG	2	6	224424	224429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917890
4592	NC_015564	CTG	2	6	224448	224453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917890
4593	NC_015564	TCT	2	6	224493	224498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917890
4594	NC_015564	TGC	2	6	224546	224551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917890
4595	NC_015564	GAG	2	6	224554	224559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917890
4596	NC_015564	CGC	3	9	224564	224572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917890
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4598	NC_015564	TC	3	6	224652	224657	0 %	50 %	0 %	50 %	333917890
4599	NC_015564	CGG	2	6	224781	224786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917890
4600	NC_015564	GC	3	6	224795	224800	0 %	0 %	50 %	50 %	333917890
4601	NC_015564	AGC	2	6	224814	224819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917890
4602	NC_015564	CAG	2	6	224925	224930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917891
4603	NC_015564	GCA	2	6	224945	224950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917891
4604	NC_015564	TCG	3	9	225141	225149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917891
4605	NC_015564	TCA	2	6	225171	225176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917891
4606	NC_015564	GGTGT	2	10	225251	225260	0 %	40 %	60 %	0 %	333917891
4607	NC_015564	GGT	2	6	225266	225271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917891
4608	NC_015564	CGA	2	6	225325	225330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917891
4609	NC_015564	GTGA	2	8	225390	225397	25 %	25 %	50 %	0 %	333917891
4610	NC_015564	T	6	6	225412	225417	0 %	100 %	0 %	0 %	333917891
4611	NC_015564	GTG	2	6	225449	225454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917891
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4615	NC_015564	CG	3	6	225652	225657	0 %	0 %	50 %	50 %	333917891
4616	NC_015564	ACG	2	6	225666	225671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917891
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4620	NC_015564	GCA	2	6	225796	225801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917891
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4623	NC_015564	CTG	2	6	225991	225996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917891
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4743	NC_015564	CGCGA	2	10	232506	232515	20 %	0 %	40 %	40 %	333917896
4744	NC_015564	GGA	2	6	232519	232524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917896
4745	NC_015564	GCT	2	6	232537	232542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917896
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4852	NC_015564	GCG	2	6	238001	238006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917903
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4863	NC_015564	CGA	2	6	238551	238556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917904
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4865	NC_015564	GATC	2	8	238662	238669	25 %	25 %	25 %	25 %	333917904
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4982	NC_015564	CGA	2	6	243678	243683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917910
4983	NC_015564	GCG	2	6	243701	243706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917910
4984	NC_015564	AGC	5	15	243752	243766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917910
4985	NC_015564	TG	3	6	243779	243784	0 %	50 %	50 %	0 %	333917910
4986	NC_015564	CTG	2	6	243815	243820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917910
4987	NC_015564	AGC	2	6	243839	243844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917910
4988	NC_015564	CGAG	2	8	243889	243896	25 %	0 %	50 %	25 %	333917910
4989	NC_015564	ATC	2	6	244046	244051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917910
4990	NC_015564	ATG	2	6	244055	244060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917910
4991	NC_015564	GCCA	2	8	244180	244187	25 %	0 %	25 %	50 %	333917910
4992	NC_015564	GCA	2	6	244206	244211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917910
4993	NC_015564	AGG	2	6	244221	244226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917910
4994	NC_015564	GTCCG	2	10	244348	244357	0 %	20 %	40 %	40 %	333917910
4995	NC_015564	GGT	2	6	244412	244417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917910
4996	NC_015564	GCG	2	6	244454	244459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917910
4997	NC_015564	CGA	2	6	244533	244538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917910
4998	NC_015564	GCC	2	6	244589	244594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917910
4999	NC_015564	CGA	2	6	244629	244634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917910
5000	NC_015564	CAG	2	6	244723	244728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917910

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